Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ8

4930519P11Rik, RIKEN cDNA 4930519P11 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519P11RikQ9CUJ8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930519P11RikQ9CUJ8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930519P11RikQ9CUJ8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms