Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fcf1Q9CTH6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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