Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp13a2Q9CTG6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms