Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snw1Q9CSN1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms