Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Nicn1Q9CQM0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Nicn1Q9CQM0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Nicn1Q9CQM0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Nicn1Q9CQM0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Nicn1Q9CQM0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Nicn1Q9CQM0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Nicn1Q9CQM0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Nicn1Q9CQM0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Nicn1Q9CQM0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Nicn1Q9CQM0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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