Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Mrpl35Q9CQL6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl35Q9CQL6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl35Q9CQL6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl35Q9CQL6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl35Q9CQL6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl35Q9CQL6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl35Q9CQL6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl35Q9CQL6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl35Q9CQL6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl35Q9CQL6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl35Q9CQL6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl35Q9CQL6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl35Q9CQL6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl35Q9CQL6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl35Q9CQL6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl35Q9CQL6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl35Q9CQL6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl35Q9CQL6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl35Q9CQL6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl35Q9CQL6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl35Q9CQL6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl35Q9CQL6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl35Q9CQL6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
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Mrpl35Q9CQL6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl35Q9CQL6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms