Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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