Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK1

Znhit3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znhit3Q9CQK1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms