Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nudt21Q9CQF3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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