Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RTRAFQ9CQE8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms