Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Rpl39lQ9CQD0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Rpl39lQ9CQD0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl39lQ9CQD0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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