Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA3

Sdhb, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhbQ9CQA3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SdhbQ9CQA3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms