Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Use1Q9CQ56 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Use1Q9CQ56 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Use1Q9CQ56 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Use1Q9CQ56 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Use1Q9CQ56 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Use1Q9CQ56 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Use1Q9CQ56 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Use1Q9CQ56 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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