Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chmp3Q9CQ10 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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