Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms