Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nsmce3Q9CPR8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nsmce3Q9CPR8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nsmce3Q9CPR8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nsmce3Q9CPR8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nsmce3Q9CPR8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nsmce3Q9CPR8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nsmce3Q9CPR8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nsmce3Q9CPR8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nsmce3Q9CPR8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nsmce3Q9CPR8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nsmce3Q9CPR8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nsmce3Q9CPR8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nsmce3Q9CPR8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nsmce3Q9CPR8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nsmce3Q9CPR8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nsmce3Q9CPR8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nsmce3Q9CPR8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nsmce3Q9CPR8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nsmce3Q9CPR8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nsmce3Q9CPR8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nsmce3Q9CPR8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nsmce3Q9CPR8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nsmce3Q9CPR8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nsmce3Q9CPR8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nsmce3Q9CPR8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nsmce3Q9CPR8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nsmce3Q9CPR8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nsmce3Q9CPR8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nsmce3Q9CPR8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nsmce3Q9CPR8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nsmce3Q9CPR8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nsmce3Q9CPR8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nsmce3Q9CPR8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nsmce3Q9CPR8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nsmce3Q9CPR8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nsmce3Q9CPR8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nsmce3Q9CPR8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nsmce3Q9CPR8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nsmce3Q9CPR8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Nsmce3Q9CPR8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms