Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms