Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrbp1Q99PL5 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms