Protein–RNA interactions for Protein: Q99PI4

Lpin3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpin3Q99PI4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lpin3Q99PI4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms