Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms