Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms