Protein–RNA interactions for Protein: Q99N96

Mrpl1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl1Q99N96 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms