Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms