Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms