Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf2Q99LE6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms