Protein–RNA interactions for Protein: Q99LB7

Sardh, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SardhQ99LB7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SardhQ99LB7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms