Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmp1Q99KU0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms