Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms