Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Reep3Q99KK1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms