Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn2aQ99KJ0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms