Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms