Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms