Protein–RNA interactions for Protein: Q99J21

Mcoln1, Mucolipin-1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcoln1Q99J21 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Mcoln1Q99J21 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mcoln1Q99J21 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mcoln1Q99J21 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mcoln1Q99J21 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mcoln1Q99J21 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mcoln1Q99J21 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mcoln1Q99J21 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mcoln1Q99J21 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mcoln1Q99J21 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mcoln1Q99J21 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mcoln1Q99J21 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mcoln1Q99J21 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mcoln1Q99J21 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mcoln1Q99J21 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mcoln1Q99J21 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mcoln1Q99J21 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mcoln1Q99J21 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mcoln1Q99J21 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mcoln1Q99J21 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mcoln1Q99J21 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mcoln1Q99J21 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mcoln1Q99J21 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mcoln1Q99J21 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mcoln1Q99J21 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mcoln1Q99J21 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mcoln1Q99J21 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mcoln1Q99J21 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mcoln1Q99J21 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mcoln1Q99J21 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mcoln1Q99J21 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mcoln1Q99J21 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mcoln1Q99J21 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms