Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Smim11aQ99J19 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Smim11aQ99J19 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Smim11aQ99J19 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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