Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
SptssbQ925E8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
SptssbQ925E8 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
SptssbQ925E8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
SptssbQ925E8 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
SptssbQ925E8 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
SptssbQ925E8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
SptssbQ925E8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
SptssbQ925E8 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
SptssbQ925E8 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
SptssbQ925E8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
SptssbQ925E8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
SptssbQ925E8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
SptssbQ925E8 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
SptssbQ925E8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
SptssbQ925E8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
SptssbQ925E8 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
SptssbQ925E8 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
SptssbQ925E8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
SptssbQ925E8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
SptssbQ925E8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
SptssbQ925E8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
SptssbQ925E8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
SptssbQ925E8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
SptssbQ925E8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
SptssbQ925E8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
SptssbQ925E8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
SptssbQ925E8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
SptssbQ925E8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
SptssbQ925E8 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
SptssbQ925E8 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
SptssbQ925E8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
SptssbQ925E8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
SptssbQ925E8 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
SptssbQ925E8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
SptssbQ925E8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
SptssbQ925E8 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms