Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms