Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms