Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.9 ms