Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Clip1Q922J3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms