Protein–RNA interactions for Protein: Q922D8

Mthfd1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mthfd1Q922D8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mthfd1Q922D8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms