Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TardbpQ921F2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TardbpQ921F2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TardbpQ921F2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TardbpQ921F2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TardbpQ921F2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TardbpQ921F2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TardbpQ921F2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TardbpQ921F2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TardbpQ921F2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TardbpQ921F2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TardbpQ921F2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TardbpQ921F2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TardbpQ921F2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TardbpQ921F2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TardbpQ921F2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TardbpQ921F2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TardbpQ921F2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TardbpQ921F2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TardbpQ921F2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TardbpQ921F2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TardbpQ921F2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TardbpQ921F2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TardbpQ921F2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TardbpQ921F2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TardbpQ921F2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TardbpQ921F2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TardbpQ921F2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TardbpQ921F2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TardbpQ921F2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TardbpQ921F2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TardbpQ921F2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TardbpQ921F2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TardbpQ921F2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TardbpQ921F2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TardbpQ921F2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TardbpQ921F2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TardbpQ921F2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TardbpQ921F2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TardbpQ921F2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TardbpQ921F2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TardbpQ921F2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms