Protein–RNA interactions for Protein: Q921E6

Eed, Polycomb protein EED, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EedQ921E6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EedQ921E6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EedQ921E6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EedQ921E6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EedQ921E6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EedQ921E6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EedQ921E6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EedQ921E6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EedQ921E6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EedQ921E6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EedQ921E6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EedQ921E6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EedQ921E6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EedQ921E6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EedQ921E6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EedQ921E6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EedQ921E6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EedQ921E6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EedQ921E6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EedQ921E6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EedQ921E6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EedQ921E6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EedQ921E6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EedQ921E6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EedQ921E6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EedQ921E6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EedQ921E6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EedQ921E6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EedQ921E6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EedQ921E6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EedQ921E6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EedQ921E6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EedQ921E6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EedQ921E6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EedQ921E6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EedQ921E6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EedQ921E6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EedQ921E6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EedQ921E6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EedQ921E6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EedQ921E6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EedQ921E6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EedQ921E6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EedQ921E6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EedQ921E6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EedQ921E6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EedQ921E6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EedQ921E6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EedQ921E6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EedQ921E6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EedQ921E6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EedQ921E6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EedQ921E6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EedQ921E6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EedQ921E6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EedQ921E6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
EedQ921E6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EedQ921E6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EedQ921E6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EedQ921E6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EedQ921E6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EedQ921E6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EedQ921E6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EedQ921E6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EedQ921E6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EedQ921E6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EedQ921E6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EedQ921E6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EedQ921E6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
EedQ921E6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EedQ921E6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EedQ921E6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EedQ921E6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EedQ921E6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EedQ921E6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EedQ921E6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EedQ921E6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EedQ921E6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EedQ921E6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EedQ921E6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EedQ921E6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EedQ921E6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EedQ921E6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EedQ921E6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EedQ921E6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EedQ921E6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EedQ921E6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EedQ921E6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EedQ921E6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EedQ921E6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EedQ921E6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EedQ921E6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EedQ921E6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EedQ921E6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EedQ921E6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EedQ921E6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EedQ921E6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EedQ921E6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
EedQ921E6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EedQ921E6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms