Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Pde6cQ91ZQ1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
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Pde6cQ91ZQ1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
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Pde6cQ91ZQ1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde6cQ91ZQ1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde6cQ91ZQ1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde6cQ91ZQ1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde6cQ91ZQ1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde6cQ91ZQ1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde6cQ91ZQ1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde6cQ91ZQ1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde6cQ91ZQ1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Pde6cQ91ZQ1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde6cQ91ZQ1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde6cQ91ZQ1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde6cQ91ZQ1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde6cQ91ZQ1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde6cQ91ZQ1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Pde6cQ91ZQ1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Pde6cQ91ZQ1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde6cQ91ZQ1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde6cQ91ZQ1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Pde6cQ91ZQ1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde6cQ91ZQ1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde6cQ91ZQ1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Pde6cQ91ZQ1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Pde6cQ91ZQ1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Pde6cQ91ZQ1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Pde6cQ91ZQ1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Pde6cQ91ZQ1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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Pde6cQ91ZQ1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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