Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Klc3Q91W40 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms