Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms