Protein–RNA interactions for Protein: Q91VT1

Nsmce2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce2Q91VT1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce2Q91VT1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms