Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms