Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE1

Lmcd1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmcd1Q8VEE1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lmcd1Q8VEE1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmcd1Q8VEE1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmcd1Q8VEE1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmcd1Q8VEE1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmcd1Q8VEE1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmcd1Q8VEE1 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmcd1Q8VEE1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmcd1Q8VEE1 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmcd1Q8VEE1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmcd1Q8VEE1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmcd1Q8VEE1 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmcd1Q8VEE1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmcd1Q8VEE1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmcd1Q8VEE1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmcd1Q8VEE1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmcd1Q8VEE1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmcd1Q8VEE1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmcd1Q8VEE1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmcd1Q8VEE1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmcd1Q8VEE1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmcd1Q8VEE1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmcd1Q8VEE1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmcd1Q8VEE1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmcd1Q8VEE1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmcd1Q8VEE1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmcd1Q8VEE1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmcd1Q8VEE1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmcd1Q8VEE1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmcd1Q8VEE1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmcd1Q8VEE1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmcd1Q8VEE1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmcd1Q8VEE1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmcd1Q8VEE1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmcd1Q8VEE1 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmcd1Q8VEE1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmcd1Q8VEE1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmcd1Q8VEE1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmcd1Q8VEE1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmcd1Q8VEE1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmcd1Q8VEE1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms