Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms