Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC8

Rapgef3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, mousemouse

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Length 918 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef3Q8VCC8 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Rapgef3Q8VCC8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Rapgef3Q8VCC8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Rapgef3Q8VCC8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Rapgef3Q8VCC8 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Rapgef3Q8VCC8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Rapgef3Q8VCC8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Rapgef3Q8VCC8 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rapgef3Q8VCC8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rapgef3Q8VCC8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rapgef3Q8VCC8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rapgef3Q8VCC8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rapgef3Q8VCC8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rapgef3Q8VCC8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rapgef3Q8VCC8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rapgef3Q8VCC8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rapgef3Q8VCC8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rapgef3Q8VCC8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rapgef3Q8VCC8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rapgef3Q8VCC8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rapgef3Q8VCC8 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms